Про кластер
Кластер Інституту прикладних проблем механіки і математики ім. Я.С. Підстригана побудований завдяки державній цільовій науково-технічній програмі впровадження і застосування грід-технологій на 2009-2013 роки, а також безпосереднього фінансування Інституту прикладних проблем механіки і математики.
В основі кластеру лежить платформа HP ProLiant s6500 та операційна система ROCKS 5.4.3.
Кластер побудований з чотирьох вузлів, мережевого комутатора, KVM-перемикача та блоку безперебійного живлення.
Керуючий вузол
Системна плата - HP ProLiant DL180 G6
Процесор - 1xIntel® Xeon® Processor E5620 (12M Cache, 2.40 GHz, 5.86 GT/s Intel® QPI)
Оперативна пам’ять - 4x2GB (PC3-10600R-9)
Жорсткий диск - 2xHP 2 TB (RAID-1)
Обчислювальні вузли на платформі HP ProLiant s6500
1:
Системна плата - HP ProLiant SL250s Gen8
Процесор - 1xIntel® Xeon® Processor E5-2620 (15M Cache, 2.00 GHz, 7.20 GT/s Intel® QPI)
Оперативна пам’ять - 4x2GB (PC3-10600R-9)
Жорсткий диск - HP 500GB
2:
Системна плата - HP ProLiant SL170s G6
Процесор - 2xIntel® Xeon® Processor E5645 (12M Cache, 2.40 GHz, 5.86 GT/s Intel® QPI)
Оперативна пам’ять - 2x6GB (PC3-10600R-9)
Жорсткий диск - HP 160GB
3:
Системна плата - HP ProLiant SL170s G6
Процесор - 2xIntel® Xeon® Processor E5620 (12M Cache, 2.40 GHz, 5.86 GT/s Intel® QPI)
Оперативна пам’ять - 2x6GB (PC3-10600R-9)
Жорсткий диск - HP 160GB
Десять обчислювальних вузлів на платформі IBM Bladecenter E (8677)
4:
Системна плата - IBM HS20
Процесор - 2xIntel® Xeon® Processor 3.20 GHz (1M Cache, 800 MHz FSB)
Оперативна пам’ять - 4x1GB (PC2-3200R-333-12-C3)
Жорсткий диск - IBM 2 x 40 GB
Мережа
Комутатор - HP V1810-24 G Switch.
!!! Зауважимо, що в усіх процесорах увімкнута технологія Intel® Hyper-Threading Technology, вона дозволяє збільшити кількість віртуальних ядер до 2xN, де N-фізична кількість ядер.
Програмне забезпечення
Усе програмне забезпечення встановлене на керуючому вузлі. Також, встановлено додаткове програмне забезпечення, яке не включено в установчі файли системи.
Операційна система
В основі програмного забезпечення кластера лежить операційна система Лінукс — ROCKS 5.4.3. (на основі CentOS 5.6) з ядром Linux-2.6.18-238.19.1.el5xen.
Компілятори та паралельне програмування
На кластері встановлені компілятори родини GNU Compiler (верс. 4.1.2, 4.4.4 та 4.7.1) з відповідною бібліотекою для паралельного програмування - OpenMPI (детальніше про компіляцію та компілятори в Компілювання та запуск задач).
Система керування ресурсами
Для керування чергами запуску задач використовується система Sun Grid Engine (SGE) 6.2u5. Детальніше про запуск задач з використанням SGE (Компілювання та запуск задач).
Грід-програмне забезпечення
ARC програмне забезпечення для доступу до українського національного гріду — nordugrid-arc-2.0.0.
Додаткове програмне забезпечення
- Abinit-7.10.4, lammps - пакети молекулярної динаміки;
- HEAsoft - програмне забезпечення для аналізу спостережуваних даних космічних телескопів;
- ScienceTools-v10r0p5 - програмне забезпечення для аналізу спостережуваних даних космічної обсерваторії ім. Фермі;
- gsl-1.16, fftw-2.1.5, lapack-3.6.0, blas-3.5.0.